Chercheur Associé, Conception Computationnelle de Canaux Ionique, Biologie Synthétique et Structurale (100%)

L'Institut de l'Ophtalmologie Moléculaire et Clinique de Bâle (IOB) recrute un Associé de Recherche. Cet institut innovant se concentre sur la recherche en vision et ses maladies.

TACHES

Conduire le cycle de conception pour les canaux ioniques. Définir des objectifs de conception clairs et pratiques.

• Développer des workflows de conception assistée par modèles.

COMPETENCES

Doctorat en biologie computationnelle ou domaine connexe requis.

COMPETENCES

en programmation et analyse de données essentielles.

• Expérience en culture cellulaire et techniques stériles. L'Institut d'Ophtalmologie Moléculaire et Clinique de Bâle (IOB) recrute un Chercheur Associé hautement motivé. L'IOB est un institut de recrute combinant recherche fondamentale et clinique. Sa

MISSIONS

est de stimuler les innovations dans la compréhension de la vision et de ses maladies et de développer de nouvelles thérapies pour la perte de vision. C'est un lieu où votre expertise sera valorisée, vos capacités mises au défi, et vos connaissances élargies. Nous recrutons un Chercheur Associé enconception computationnelle de canaux ioniques et de protéines membranaires(conception de protéines, biologie structurale et synthétique). Dans ce rôle, vous piloterez un cycle complet de conception–construction–test :concevoir computationnellement des canaux ioniques ingénierés(par exemple, des protéines membranaires sensibles à la lumière),traduire les conceptions en constructions d'expression, etvalider la fonction dans des systèmes mammifères en collaboration avec des collègues réalisantdes essais quantitatifs (avec accès à l'électrophysiologie à haut débit et à l'imagerie avancée). Le offre d'poste combine des approches modernes basées sur la structure et la conception générative avec une exécution expérimentale pratique (culture cellulaire de mammifères, transfection/transduction, optimisation de l'expression, et caractérisation protéique/fonctionnelle). Vos responsabilitésGérer le cycle de conception computationnelle et structurale pour les canaux ioniques et les protéines membranaires sensibles à la lumière (concept hypothèses de conception criblage in silico sélection des candidats pour tests), en étroite interaction avec les collaborateurs expérimentaux et translationnels. Définir des objectifs clairs de conception et des critères de succès, et traduire les conceptions en plans pratiques de construction et d'essais.

• Développer et appliquer des workflows de conception protéique assistés par modèles appris (prédiction de structure, repliement inverse/conception de séquence, notation de séquence, et méthodes de proposition générative) et les intégrer avec les retours expérimentaux à travers des cycles de conception itératifs.
• Exécuter un workflow de validation expérimentale ciblée (travail pratique limité au laboratoire) : culture cellulaire mammifère de routine, clonage/gestion des constructions d'ADN selon les besoins, transfection/transduction, et tests d'expression à petite échelle dans HEK/CHO (ou équivalent).
• Coordonner et interpréter les résultats fonctionnels générés avec l'équipe (par exemple, électrophysiologie, imagerie, essais biochimiques), en utilisant les résultats pour itérer les conceptions. Communiquer clairement les progrès et résultats dans les mises à jour internes, la documentation écrite, et les réunions de projet ; contribuer aux présentations en conférence et aux manuscrits selon les besoins.
• Maintenir des enregistrements précis et une communication efficace au quotidien avec votre superviseur et vos collaborateurs.

EXIGENCES

Doctorat (ou expérience équivalente) en biologie computationnelle, ingénierie des protéines, biologie structurale, biophysique, biochimie, biologie moléculaire/cellulaire, ou domaine étroitement lié. 3 ans d'expérience postdoctorale (ou équivalente) avec au moins deux des éléments suivants :conception protéique computationnelle/basée sur la structure (en particulier protéines membranaires ou canaux ioniques),workflows de conception protéique assistés par modèles appris (par exemple, prédiction de structure, repliement inverse/conception de séquence, notation de séquence basée sur des modèles de langage protéique, et outils de proposition générative de séquence/structure),stratégies de conception et de criblage génératives ou basées sur des bibliothèques (incluant l'évolution dirigée),biologie moléculaire pour des cycles rapides de conception–construction–test (clonage, conception de constructions, optimisation de l'expression),pipelines de découverte/minage métagénomique et annotation,criblage fonctionnel quantitatif (essais en microplaque et/ou lectures électrophysiologiques/imagerie). Forte motivation pour développer et affiner des méthodes principalement in silico, avec une composante expérimentale légère mais compétente. Très organisé et précis ; à l'aise pour gérer plusieurs itérations de conception avec une documentation rigoureuse et un contrôle de version.

Aptitudes

solides en programmation et analyse de données (par exemple, Python) et expérience avec des logiciels/chaînes d'outils de biologie structurale et de conception protéique (par exemple, Rosetta ; workflows de prédiction de structure tels que Alpha

• Fold ou équivalent ; outils de repliement inverse/conception de séquence et de conception générative ; chaînes d'outils MD/analyse).

COMPETENCES

pratique en culture cellulaire de mammifères et technique stérile ; familiarité avec les environnements BSL1/BSL2. Preuves d'impact en conception protéique (par exemple, travaux en tant que premier auteur, contributions open-source, méthodes publiées, ou résultats démontrés de fonctions ingénierées).

NOUS OFFRONS

Excellence scientifique & impact– Rejoignez un institut de recherche hautement motivé à la pointe de la recherche sur la vision, soutenu par des installations à la pointe de la technologie dans un environnement de recrute international et innovant à Bâle

• Un environnement conçu pour la performance– Nous créons des conditions qui vous permettent de donner le meilleur de vous-même : un engagement à soutenir l'excellence à long terme et des politiques favorables à la famille
• Soutien pratique & accessibilité– Emplacement pratique à Bâle avec d'excellents transports publics, repas subventionnés, soutien à la garde d'enfants, et accès aux installations sportives universitaires (Unisport) Une culture de confiance mutuelle– Nous recherchons des collègues qui apportent motivation, innovation et dévouement ; en retour, nous fournissons les ressources, la flexibilité et l'environnement où un travail exceptionnel prospère

Application

/

CONTACT

Les candidats

intéressés doivent soumettre leur

Application

en ligne via la plateforme de recrutement. Veuillez inclure une lettre de motivation et votre curriculum vitae. Pour plus d'informations, veuillez visiter notre site webwww. chou

CONTACT

er le Dr Guilherme Testa-Silva (guilherme. ch)

CONTACT

Ressources Humaines

• Équipe de recrutementIOB - Institut d'Ophtalmologie Moléculaire et Clinique de Bâle.