Data scientist en pathologie moléculaire diagnostique 80-100%
Universitätsspital ZürichL'unité de pathologie moléculaire du département de pathologie et de pathologie moléculaire de l'hôpital universitaire de Zurich est une unité leader en matière de développement en médecine de précision, y compris la génomique des tumeurs et l'intégration de données multiomiques. Les analyses diagnostiques incluent de nombreuses méthodes omiques modernes et technologies de pointe : séquençage du génome entier, séquençage en masse de l'ARN, réseau de méthylation, pathologie numérique, séquençage par panel. Nos scientifiques analysent les données brutes de ces tests pour créer des rapports de diagnostic, développer de nouvelles méthodes et soutenir des projets de recherche. L'hôpital universitaire de Zurich est l'un des plus grands hôpitaux de Suisse. Unsere über 8'600 Mitarbeitenden et rund 700 Auszubildende setzen sich täglich für das Wohl unserer Patient:innen ein. Data scientist en pathologie moléculaire diagnostique 80-100%
immédiatement ou après accord, limité à 1 an, dans le but de prolonger
Vos principales tâches
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Analyse indépendante, contrôle qualité et interprétation des données NGS et multi-omiques dans un contexte de diagnostic
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Développement, validation et mise en œuvre de pipelines bioinformatiques pour les diagnostics moléculaires de routine
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Analyses immunogénomiques avec interprétation cliniquement pertinente
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Application des méthodes d'apprentissage automatique/IA aux données omiques, en mettant l'accent sur la robustesse et l'interprétabilité
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Traduction de nouvelles méthodes en diagnostics de routine, y compris la documentation et la validation
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Préparation de rapports cliniques en collaboration avec des pathologistes et des biologistes moléculaires
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Soutien à la formation du personnel médical et de laboratoire à l'interprétation des données et aux flux de travail bioinformatiques
Votre profil
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MSc ou PhD en bioinformatique, biologie computationnelle, informatique médicale ou dans un domaine connexe
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Forte expérience en analyse de données NGS/omics dans un contexte appliqué
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Maîtrise de Python et/ou R (Bioconducteur)
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Solide compréhension de la biologie moléculaire et de la génétique, avec la capacité d'interpréter des données dans un contexte biologique et clinique
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Solide compréhension des statistiques et de l’apprentissage automatique
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Expérience avec les systèmes de gestion de flux de travail (Nextflow, Snakemake) et la conteneurisation (Docker/Singularity)
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Excellentes compétences analytiques, de communication et de rédaction
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Anglais requis, l'allemand est un avantage
Qualifications préférées : expérience en génomique du cancer, immunogénomique, transcriptomique ou épigénétique, métagénomique, analyse d'images basée sur l'IA, gestion de données/rapports structurés, multiomique intégrative ou travail dans un environnement clinique/médical
Voir les avantages
Nous proposons un poste interdisciplinaire reliant l'interprétation et la communication de données massives de diagnostic moléculaire à la science clinique au sein du département de pathologie et de pathologie moléculaire de l'hôpital universitaire de Zurich, dans un cadre de collaboration solide comprenant des experts d'autres institutions suisses de premier plan. A Zurich, vous serez immergé dans un environnement scientifique et académique dynamique, ouvert et motivant. Nous sommes soutenus par des financements intra et extra-muros et sommes impliqués dans plusieurs collaborations nationales et internationales à haute visibilité. Hôpital universitaire de Zurich
8091 Zurich
